
Constituée en 1984, l’AJAM est chargée par la République et Canton du Jura d’organiser l’accueil, l’hébergement et la prise en charge sociale des demandeurs d’asile attribués au canton du Jura (1% des demandeurs d’asile arrivés en Suisse). Elle a en outre reçu le mandat de l'accompagnement social des réfugiés statutaires.
Une Convention signée avec le Gouvernement jurassien définit le mandat de l'AJAM de même que ses relations avec les services de l’Etat. Elle précise les tâches de l’institution et le financement de ses activités.
La responsabilité de l’AJAM est confiée à un comité de gestion, dont le président et un membre sont désignés par le Gouvernement jurassien. Il est représentatif des différentes sensibilités politiques, des associations caritatives ou des oeuvres d’entraide à caractère régional et des églises reconnues. M. Jean-Luc Portmann préside actuellement l’AJAM.
L’AJAM emploie une vingtaine de collaborateurs. La direction est confiée au Délégué cantonal, M. Francis Charmillot, dont la nomination relève du Gouvernement jurassien.
A la fin de l'année 1998, l'AJAM hébergeait 800 demandeurs d'asile. Au mois de juillet 1999, au plein fort du conflit dans les Balkans, 1000 demandeurs d'asile d'asile étaient accueillis dans le canton du Jura. Ce nombre de personnes hébergées dans la République et Canton du Jura constitue un record dans toute l'histoire de l'AJAM.
Depuis quelques années, le nombre de demandeurs d’asile hébergés est fluctuant:
| Année |
Nombre de demandeurs d'asile (moyenne) |
| 2000 | 750 |
| 2001 | 500 |
| 2002 | 450 |
| 2003 | 450 |
| 2004 | 400 |
| 2005 | 330 |
| 2006 | 300 |
| 2007 | 280 |
| 2008 | 334, dont 46 réfugiés statutaires |
| 2009 | 380, dont 80 réfugiés statutaires |
| 2010 | 410, dont 120 réfugiés statutaires |
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